Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ercc8Q8CFD5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ercc8Q8CFD5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ercc8Q8CFD5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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