Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc178Q8CDV0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms