Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lrrc9Q8CDN9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lrrc9Q8CDN9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms