Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc38Q8CDN8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc38Q8CDN8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms