Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp20Q8C6M1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp20Q8C6M1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp20Q8C6M1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usp20Q8C6M1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usp20Q8C6M1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp20Q8C6M1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms