Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms