Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms