Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nek11Q8C0Q4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nek11Q8C0Q4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nek11Q8C0Q4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nek11Q8C0Q4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nek11Q8C0Q4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nek11Q8C0Q4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nek11Q8C0Q4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek11Q8C0Q4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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