Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TtpaQ8BWP5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TtpaQ8BWP5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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