Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Kdm4aQ8BW72 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kdm4aQ8BW72 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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