Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms