Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Zbed4Q80WQ9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Zbed4Q80WQ9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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Zbed4Q80WQ9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Zbed4Q80WQ9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed4Q80WQ9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed4Q80WQ9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Zbed4Q80WQ9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zbed4Q80WQ9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Zbed4Q80WQ9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Zbed4Q80WQ9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Zbed4Q80WQ9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Zbed4Q80WQ9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Zbed4Q80WQ9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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