Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NischQ80TM9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NischQ80TM9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms