Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Actn1Q7TPR4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Actn1Q7TPR4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms