Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms