Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc6aQ78XR0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trappc6aQ78XR0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6aQ78XR0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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