Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vma21Q78T54 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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