Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msrb2Q78J03 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms