Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Higd1cQ76I25 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms