Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Topbp1Q6ZQF0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms