Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ssxb3Q6XAS4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ssxb3Q6XAS4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ssxb3Q6XAS4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Ssxb3Q6XAS4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssxb3Q6XAS4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssxb3Q6XAS4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssxb3Q6XAS4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssxb3Q6XAS4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssxb3Q6XAS4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ssxb3Q6XAS4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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