Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Sohlh1Q6IUP1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sohlh1Q6IUP1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms