Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarca2Q6DIC0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca2Q6DIC0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms