Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Kiaa1549Q68FD9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms