Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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Sbno1Q689Z5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sbno1Q689Z5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Sbno1Q689Z5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Sbno1Q689Z5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Sbno1Q689Z5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Sbno1Q689Z5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Sbno1Q689Z5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sbno1Q689Z5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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