Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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PtprdQ64487 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprdQ64487 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprdQ64487 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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PtprdQ64487 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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PtprdQ64487 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PtprdQ64487 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PtprdQ64487 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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