Protein–RNA interactions for Protein: Q64302

Tm4sf1, Transmembrane 4 L6 family member 1, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf1Q64302 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm4sf1Q64302 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm4sf1Q64302 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms