Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Irf4Q64287 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Irf4Q64287 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Irf4Q64287 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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