Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col4a5Q63ZW6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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