Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Polr2kQ63871 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Polr2kQ63871 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms