Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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SnrpcQ62241 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SnrpcQ62241 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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