Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sycp1Q62209 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms