Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prkd1Q62101 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prkd1Q62101 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prkd1Q62101 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prkd1Q62101 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prkd1Q62101 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prkd1Q62101 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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