Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Hes3Q61657 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hes3Q61657 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms