Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Pacsin1Q61644 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pacsin1Q61644 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pacsin1Q61644 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pacsin1Q61644 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pacsin1Q61644 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pacsin1Q61644 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pacsin1Q61644 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pacsin1Q61644 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pacsin1Q61644 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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