Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ecm1Q61508 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm1Q61508 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ecm1Q61508 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm1Q61508 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ecm1Q61508 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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