Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ift88Q61371 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ift88Q61371 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ift88Q61371 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ift88Q61371 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ift88Q61371 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ift88Q61371 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ift88Q61371 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ift88Q61371 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ift88Q61371 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ift88Q61371 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ift88Q61371 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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