Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp4Q60972 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms