Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atf3Q60765 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms