Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SkilQ60665 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms