Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf123Q5XPI3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms