Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psme4Q5SSW2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psme4Q5SSW2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms