Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sun3Q5SS91 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms