Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc88aQ5SNZ0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms