Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc1Q5NCF2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms