Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spire1Q52KF3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spire1Q52KF3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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