Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pdp2Q504M2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pdp2Q504M2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pdp2Q504M2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pdp2Q504M2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pdp2Q504M2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Pdp2Q504M2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Pdp2Q504M2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Pdp2Q504M2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pdp2Q504M2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pdp2Q504M2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pdp2Q504M2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Pdp2Q504M2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdp2Q504M2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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