Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Carmil2Q3V3V9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms