Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccdc110Q3V125 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms