Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc27Q3V036 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms